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PCR檢查支原體是對藥典方法的重要補充

更新時間:2020-11-13  |  點擊率:797

 

支原體是導(dǎo)致體外細(xì)胞污染的重要污染源。用于生物制品生產(chǎn)的細(xì)胞基質(zhì)或治療性細(xì)胞。產(chǎn)品被支原體污染后,支原體或支原體代謝產(chǎn)物可進(jìn)入人體,并對人體產(chǎn)生嚴(yán)重危害。因此,對支原體污染的有效檢測是確保細(xì)胞基質(zhì)及治療性細(xì)胞產(chǎn)品質(zhì)量的前提。


支原體傳統(tǒng)檢測方法為培養(yǎng)法和指示細(xì)胞染色法,這兩種均是“藥典方法”。但缺點是耗時長,靈敏度低。此外,這兩種方法均無法明確所感染支原體的類型。

因此,采用PCR或qPCR檢測支原體的高度保守序列,用于制藥工業(yè)的放行檢測,逐漸成為一種趨勢。當(dāng)然,核酸擴(kuò)增法也存在一定的問題,因為它檢的不是活的支原體,而是支原體的DNA。另外,它容易受到樣本基質(zhì)中的物質(zhì)干擾,如果靈敏度達(dá)不到,有時容易漏檢。而培養(yǎng)法的問題是,有些支原體無法在培養(yǎng)基上生長,因此也不會被發(fā)現(xiàn)。而核酸擴(kuò)增法可以覆蓋100多種支原體,且大大節(jié)省時間,并且擴(kuò)增產(chǎn)物還可測序,以終確定污染支原體的物種,增加可追溯性。因此還是值得大力推廣。

現(xiàn)在,市面上有些商品化試劑盒可以挑選,但需要注意它們應(yīng)達(dá)到歐洲藥典或日本藥典標(biāo)準(zhǔn),例如靈敏度、耐用性和特異性方面,需要經(jīng)過全面驗證。下面以德國MB公司的試劑盒(Venor®GeM qEP)為例,對這類試劑盒略做介紹。

該試劑盒擴(kuò)增柔膜體對應(yīng)的16S rRNA上的特異序列, 而真核細(xì)胞和其他細(xì)菌DNA不會被擴(kuò)增。
 
試劑盒可同時對細(xì)胞培養(yǎng)上清篩查以及那些需要遵循歐洲藥典和日本藥典放行檢測。整個檢測小于3小時。和一些生化和細(xì)胞學(xué)方法相比,PCR具有更高的靈敏度和準(zhǔn)確性。
 
試劑盒包含所有必要的PCR組分,包括引物和探針。其中內(nèi)控DNA可用于鑒定PCR抑制或DNA抽提問題帶來的假陰性。內(nèi)控DNA可直接加到PCR預(yù)混液里,或加到DNA抽提之前的樣本中。它可用于驗證DNA抽提和qPCR擴(kuò)增過程。內(nèi)控對照的擴(kuò)增結(jié)果在560nm檢測(HEX通道),而支原體的擴(kuò)增在520nm檢測(FAM通道)。
 
試劑盒包括dUTP,它替代dTTP,方便用尿嘧啶DNA糖基酶(UNG)監(jiān)視假陽性。該試劑盒不包含UNG。

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